Horan wuchs mit seinem Vater Bobby Horan, seiner Mutter Maura Gallagher und seinem älteren Bruder Greg in Mullingar auf. Als er fünf Jahre alt war, ließen sich seine Eltern scheiden. Nachdem er bei beiden gewohnt hatte, entschied er sich, bei seinem Vater in Mullingar zu bleiben. Sein Stiefvater Chris stammt aus England. Niall besuchte die Coláiste Mhuire, eine christliche Jungen-Schule in Mullingar.