Der junge Student Narumi Takayuki ist im 3. Jahr der Oberschule. Seine Klassenkameraden Mitsuki, Shinji sind bereits fleissig am Lernen für die Aufnahmeprüfung an der Universität, im Gegensatz zu Takayuki. Die junge und schüchterne Haruka hat sich in Takayuki verliebt und durch ihre beste Freundin Mitsuki kann sie ihm auch ihre Liebe gestehen. Die Beziehung zwischen den beiden läuft am Anfang jedoch nicht ganz so gut, da es so scheint als wäre Takayuki nicht wirklich in sie verliebt. Mit der Zeit jedoch ändert sich seine Einstellung und er verliebt sich richtig in sie. Jedoch währt dieses Glück nicht lange. Dadurch das Takayuki von Mitsuki, an ihrem Geburtstag, aufgehalten wurde und sich dabei von ihr überreden liess ihr einen Ring als Geburtstagsgeschenk zu kaufen, kommt dieser zu spät zu seinem Date mit Haruka. Kurz nachdem er mit Verspätung am Treffpunkt ankommt bemerkt er wie eine Menschenmenge und ein Rettungswagen sich in der Nähe, wo er sich mit Haruka treffen wollte, befinden. Takayuki sieht eine Blutlache auf dem Boden und die unverkennbare rosa Schleife, welche Haruka meistens in ihrem Haar trägt. Erst jedoch nachdem der Anwesende Polizist durch sein Funkgerät den Unfall meldet und dabei den Namen Suzumiya Haruka nennt, ist es eindeutig das die Blutlache und die Schleife von Haruka sind, welche durch einen Autounfall ins Koma gefallen ist. Dies ist ein harter Schlag für Takayuki, sodass er in eine schwere Depression fällt. Er fühlt sich schuldig durch seine Verspätung am Unfall von Haruka Schuld zu sein. Mitsuki bemerkt wie sich Takayuki immer mehr von der Aussenwelt abkapselt und sich nicht mehr wirklich um sich selber kümmert. So beschliesst sie sich um ihn zu kümmern. Dabei kann sie ihre Gefühle, die sie für ihn hat, nicht mehr länger unterdrücken, und gesteht ihm ihre Liebe.

Drei Jahre später wacht Haruka aus ihrem Koma auf und weiss nicht, dass bereits drei Jahre vergangen sind. Sie leidet unter einen Art Amnesie, weswegen die behandelnde Ärztin wünscht diese vergangene Zeit nicht vor Haruka zu erwähnen. Sie möchte damit die zerbrechliche Psyche von Haruka schützen, um zu verhindern, dass sie erneut in ein Koma fällt. Da für Haruka keine Zeit vergangen ist, und sie Takayuki immer noch liebt, gerät Takayuki in einen Konflikt seiner Gefühle und Empfindungen zwischen Mitsuki und Haruka.